Już w XIV w. w środku wsi stał drewniany kościół pw. św. Jana Ewangelisty. Później zastąpiono go kaplicą nowogotycką Maryi Panny. Obecny kościół św. Małgorzaty (sv. Markéty) stoi osamotniony na szczycie, w kierunku zachodnim za Szonowem. Jego budowę rozpoczęto w 1726 r. i prawdopodobnie zakończono w ciągu czterech lat. Także autorstwo tego kościoła przypisuje się Kilianowi Ignacemu Dientzenhoferowi.

Kościół jest w ciekawy sposób skierowany swoim frontem z wieżami w kierunku, widocznego stąd, broumovskiego klasztoru. Rzut podstawy tworzy rozciągnięty ośmiokąt, Fasada wejściowa jest wzbogacona o parę graniastosłupowych wież z szeroko rozpostartym blokiem wejściowym. Na końcu znajdują się dwie zakrystie, pomiędzy którymi umieszczono prezbiterium. Świątynia ma łącznie sześć wejść, z czego trzy prowadzą do przedsionka, a trzy do kościoła. Początkowo kościół miał cztery dzwony, jednak większość była zarekwirowana w czasie pierwszej wojny światowej. W 1927 r. broumovski warsztat ludwisarski Octava Wintera wykonał trzy nowe dzwony. Także te trzy dzwony zostały skonfiskowane w czasie drugiej wojny światowej, a pozostały dzwon został później przewieziony do wieży kościoła klasztornego w Broumově. Wnętrze kościoła w Szonowie uległo znacznym zniszczeniom i zostało rozkradzione. Pomimo tego ponownie odbywają się tu nabożeństwa.